重磅由于论文图片被重复使用,整个生物医
编者按
在发布到bioRxiv的新预印本中,图像侦察扫描了由美国微生物学会(ASM)出版的分子和细胞生物学(MCB)七年中发表的数百篇论文。研究人员发现了59篇可能有问题的论文,其中五篇被撤回。从这些研究结果和另一篇扫描重复率的论文中推断,研究人员提出,可能需要从文献中清除数以万计的论文。这篇论文是我们数据库中迄今为止记录的撤回论文的两倍,这个数据库可追溯到20世纪70年代。
RetractionWatch(RW):你们发现了59个不适当复制的潜在实例-您是如何定义此问题并验证图像是否存在问题?
ArturoCasadevall(AC):Elisabeth发现了图像,她具有根据模式发现问题的卓越能力。然后她把它们送到FerricFang和我,我们都需要同意这个数字被归类为有问题。
ElisabethBik(EB):我使用了与mBio研究中完全相同的标准,我在其中扫描了20,篇论文。我们标记了三种类型的图像复制问题:
在同一篇论文中复制完全相同的组(例如Western印迹条或细胞照片),但代表不同的实验。
类型I的例子
具有移位的图片的复制(例如,显示重叠区域的2张照片,或者移位或旋转的Western印迹)
类型II的例子
照片内的复制(例如,相同蛋白质印迹内的2条泳道,在相同照片内多次可见同一细胞)
类型III的例子
请注意,这些都是明显的图像重复,我并不完美,但如果有疑问,我不会标记它。
RogerDavis(RD):所有确定的图像异常,然后受[科学诚信办公室]图像分析,正式确认图像问题的存在。
RW:在59个案例中,42个纠正了,但只有5个文件被撤回。这会让你们感到惊讶和/或失望吗?
AC:我认为我们预计大多数图像问题是组装数字错误的结果,所以10%的撤回并不令人惊讶。
RD:如果我们发现有图像问题的论文,就会联系原始数据的作者。然后使用ORI取证工具检查构建的数字和原始数据。严格遵循COPE指南,决定不采取行动,纠正或撤回。
EB:我们相信作者说他们说重复是错误的结果。我们的目标是确保科学是正确的,而不是惩罚。在大多数情况下,可以纠正错误,以便其他人能够使用正确的数据集进行未来的实验和引用。
RW:12篇论文没有采取任何行动。你们陈述的原因是:“实验室已经关闭(2篇论文),通讯作者问题(4篇论文),以及事情发生久远(6篇论文)。”这些合理的解释,依你们的意见?
AC:ASM的政策是调查不超过6年的指控。我认为这是合理的。6年的限制是基于ORI的诉讼时效-这是ASM采用的理由。
FerricFang(FF):根据经验,年ORI制定了6年的限制,在6年多的时间内对不当行为进行指控是不切实际的,ASM期刊也有类似的经历。
EB:许多发布商使用此时间限制,而不仅仅是ASM,并且有几个很好的理由可以使用它。大多数实验室不保存比那个时间更早的实验室笔记本,而博士后和研究生已经走了。追踪很久以前发生的错误几乎是不可能的。5年以上的论文被引用的可能性也较低,其他研究可能已经确认或拒绝来自具有重复图像的较旧论文的发现。
RW:您推断,如果需要撤回10%的MCB论文由于图像重复使用,那么整个生物学领域可能需要撤回35,篇论文。你是如何进行这种计算的,它是基于什么假设的?
EB:我们将以前的研究结果推断到其他文献。在我们之前的研究中,我们分析了20,篇论文,发现3.8%包含重复的图像。我们知道,由于各种原因(不同的编辑流程,不同水平的同行评审),重复图像的比例因期刊而异。由于该百分比是根据来自40种具有不同影响因子的不同期刊的论文计算出来的,因此该百分比可作为整个生物医学文献的合理代表。10.1%是在MCB数据集中撤回的论文的百分比。当然,这是一个比mBio论文小得多的数据集,但它是一个经过认真研究的集合。
如果-年在PubMed中索引8,,份生物医学出版物,3.8%包含有问题的图像,并且该组中10.6%(CI为1.5-19.8%)包含充分中科让您告别白癜风秀健康江西治疗白癜风医院
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